Le microbiote intestinal est un ensemble de microorganismes complexe vivant en symbiose avec l’hôte.
L’évolution récente des techniques moléculaires a permis de mieux connaitre la composition du microbiote et d’identifier trois groupes appelés entérotypes.
L’alimentation, le mode d’accouchement et l’environnement sont des facteurs modulant la composition bactérienne.
Il existe aujourd’hui un réel engouement de la recherche pour décrire la nature des interactions hôte-microbiote et leurs conséquences en matière de santé. On sait désormais que le microbiote joue un rôle dans la protection de la physiologie intestinale, ainsi que dans les fonctions métaboliques et immunitaires.
Ainsi, un déséquilibre de cette flore est impliqué dans l’obésité et les manifestations allergiques. L’utilisation de pré- et probiotiques et le transfert de flore fécale, pourraient, en modulant le microbiote intestinal, devenir de nouvelles approches thérapeutiques.